Із самого початку «Молдова за мир» організувала свою роботу в кількох відділах, виходячи з невідкладних потреб біженців та біженок з України. У перші тижні десятки, а іноді й сотні людей пропонували свою підтримку і викликалися волонтерами, вдень  і вночі, щоб підтримувати їхню роботу.

Пізніше виникла потреба у нових напрямках діяльності – права людини, Громадський Центр та розробка нової системи управління волонтерами.

Ініціатива не має конкретного лідера чи представника, а рішення приймаються шляхом консенсусу на щотижневих зборах.